期刊论文查重软件主要通过比对文本相似度来识别引用和抄袭内容。当文本中存在与其他文献相似度较高的段落时，查重软件会标记这部分内容并给出相应提示。同时，查重软件还能检测到抄袭内容，通过比对整篇文章与已有数据库的内容，找出相似度过高的部分。综合利用文本比对、关键词匹配等技术，查重软件能够准确识别引用和抄袭内容。

另外，期刊论文查重软件还可以通过检测格式、排版等方面来辅助识别引用和抄袭。一些软件还支持在线查重，能够及时发现文本相似度过高的情况，帮助作者及时修改。总的来说，期刊论文查重软件在识别引用和抄袭方面发挥着重要作用，有助于提高学术研究的质量和水平。