一种常见的方法是通过学术数据库提供的API接口，将期刊论文查重软件与学术数据库进行对接。通过API接口，可以实现自动化检索和对比论文相似度的功能。另一种方法是将学术数据库下载的数据导入到查重软件中，进行本地比对。此外，还可以通过特定格式的文件进行数据交换，实现查重软件与学术数据库的数据对接。

另外一种方法是利用开放数据接口（OpenAPI）进行对接，通过API接口实现数据的传输和交换。此外，一些期刊论文查重软件也提供了与特定学术数据库对接的插件或功能，用户可以直接在软件中设置相关参数，实现与学术数据库的对接。同时，一些学术数据库也提供了专门的插件或工具，方便用户将论文数据导入到查重软件中进行检测。