期刊论文查重软件在论文修改中的应用主要体现在以下几个方面：1.检测抄袭：查重软件可以帮助作者及时发现论文中存在的抄袭问题，保障学术诚信。2.修改建议：一些查重软件还会提供修改建议，帮助作者改进论文表达和结构，提高论文质量。3.排版规范：部分查重软件还具备排版规范功能，帮助作者按照学术期刊要求进行格式调整，提升发表成功率。

除此之外，期刊论文查重软件还可以帮助作者检查论文中的语法错误、拼写错误等问题，提高论文的语言表达规范性。同时，查重软件还能够帮助作者检测论文中的重复内容，避免自我抄袭，保证论文的原创性。总的来说，期刊论文查重软件在论文修改中的应用多方面，对于提升学术论文质量和学术水平起着重要作用。